Nommé en avril 2008 pour mettre en place les agences régionales de santé (ARS), Jean-Marie Bertrand a quitté ses fonctions de secrétaire général des ministères chargés des Affaires sociales. Conseiller maître à la Cour des comptes, le haut fonctionnaire a réintégré la Rue Cambon et a été remplacé par Emmanuelle Wargon, issue elle aussi de la Cour des comptes.

À 39 ans, l’ancienne directrice de cabinet de Martin Hirsch lorsqu’il était haut commissaire aux Solidarités actives, est passée par HEC et Sciences-Po Paris avant de rejoindre l’ENA. En avril 2001, elle rejoint le cabinet de Bernard Kouchner au ministère délégué à la Santé, en tant que conseillère technique, chargée de la politique du médicament et autres produits de santé. En mai 2002, elle devient adjointe au directeur général de l’Agence française de sécurité sanitaire des produits de santé (Afssaps), avant de prendre, en mars 2006, la direction déléguée à la coordination et au contrôle interne de l’Assistance publique-Hôpitaux de Paris. Un parcours sans faute qui conduit la fille de l’ancien ministre Lionel Stoléru à diriger le cabinet de Martin Hirsch en 2007.

Le secrétariat général des ministères chargés des Affaires sociales est rattaché à trois ministères : celui du Travail, de la Solidarité et de la Fonction publique, celui de la Santé et des Sports et celui de la Jeunesse et des Solidarités actives.